Estructura genética de poblaciones indígenas del occidente colombiano mediante el uso de marcadores ligados al cromosoma Y

  • Fabián Andrés Franco Universidad del Valle
  • Guillermo Barreto Universidad del Valle, Facultad de Ciencias Naturales y Exactas

Resumen

Colombia presenta una amplia gama de etnias amerindias, sin embargo, es preocupante la escasa y fragmentada información genética que se tiene de ellas. Comprender su estructura genética y niveles de flujo génico es urgente para inferir las relaciones filogenéticas, origen y procesos de mestizaje ocurridos a través del tiempo. En el presente estudio, utilizando marcadores ligados al cromosoma Y (Y- STR, Y-SNP) se analizaron 204 amerindios del occidente colombiano (131 procesados en este trabajo y 73 con datos tomados de la literatura) pertenecientes a las etnias Nasa (Páez), Coyaima, Pijao, Pastos, Awakuaiker, Emberá duma, Coconuco, Guambiano (Misak), Emberá chamí y Yanaconas. El haplogrupo Q1a2a1a1*-M3 presentó la mayor frecuencia en las etnias estudiadas (58% en promedio). Con la excepción de Pijaos y Yanaconas (frecuencias del 17% y 40%, respectivamente), los haplogrupos de origen amerindio Q1a2a1a1*-M3 y Q1a2*- M346 (M242, xM3), analizados en conjunto, fueron los más frecuentes (68% en promedio), alcanzando valores superiores al 80% en los Emberas, Guambianos y Awa. Los haplogrupos para linaje europeo presentaron una frecuencia promedio del 15%, mientras los africanos 6% y de otras procedencias (J, I, F, T y G) 11%. Fue observado un conjunto de alelos Y-STRs en proceso de fijación en estas comunidades y una estructura genética significativa (RST= 0.15129), mostrando a los Pastos aislados de los demás grupos indígenas, sugiriendo una procedencia migratoria diferente y la posible influencia de la orografía andina en el flujo génico indígena. El presente trabajo hace una contribución importante al esclarecimiento de la estructura genética amerindia del occidente colombiano. © 2017. Acad. Colomb. Cienc. Ex. Fis. Nat.

Descargas

La descarga de datos todavía no está disponible.

Biografía del autor/a

Guillermo Barreto, Universidad del Valle, Facultad de Ciencias Naturales y Exactas

 

                                               CURRICULUM VITAE

                                              

 

I.         DATOS PERSONALES

 

Nombre y Apellidos:                         GUILLERMO BARRETO RODRIGUEZ

Documento de Identidad:                  cc. No. 6.437.545 de Roldanillo - Valle

Cargo Actual:                                    Profesor Titular. Sección de Genética. Depto. de Biología. Universidad del Valle. Cali - Colombia.

                                                           Funciones: Docencia a nivel de Pregrado y Postgrado (Maestría y Doctorado), Investigación y Extensión.

                                                           Director Grupo de Investigación en “Genética Molecular Humana”. 1999 – Hoy.

                                                           Director Servicio de Extensión en Genética Humana, Sección Genética, Facultad de Ciencias Naturales y Exactas. Universidad del Valle. 1996 – Hoy.

                                                           Teléfonos: (2) 321 2152 y 339 32 43.

FAX: (2) 339 3243

                                                           Apartado Aéreo 25360. Cali - Valle.

                                                           E. mail: guillermo.barreto@correounivalle.edu.co

 

 

II.        FORMACION ACADEMICA

 

POSTGRADUACION

 

DOCTORADO (PhD)           Departamento de Bioquímica e Inmunología, Instituto                                                       de Ciencias Biológicas, Universidad Federal de                                                                 Minas Gerais, UFMG, Belo Horizonte, Brasil. 1991 -                                                        1995.

                                               Título: Doctor en Ciencias (PhD).

                                               Area: Biología Molecular.

 

MAGISTER               Departamento de Genética, Instituto de Biociencias,                                                          Universidad Federal do Río Grande do Sul, UFRGS,                                                         Porto Alegre, Brasil. 1987 - 1990.

                                   Título: Magister en Genética.

                                   Area: Genética Humana.

 

PREGRADO

 

BIOLOGO                  Departamento de Biología, Facultad de Ciencias,                                                               Universidad del Valle, Cali - Colombia. 1976 - 1981.

                                   Título: Biólogo (Énfasis en Genética).

 

III.      PREMIOS

 

PREMIO NACIONAL. VIDA Y OBRA A UN SOCIO DE LA ASOCIACIÓN COLOMBIANA DE CIENCIAS BIOLÓGICAS (ACCB). 2011. De acuerdo con los estatutos de la ACCB este premio se otorga un miembro activo que se haya distinguido por una vida consagrada a la docencia e investigación en Ciencias Biológicas y que haya prestado servicios importantes a la Asociación.

Entregado en la ciudad de Medellín el 14 de Octubre de 2011en el marco del XLVI Congreso Nacional de Ciencias Biológicas.

 

PREMIO AL MEJOR TRABAJO EN LA MODALIDAD DE POSTGRADO 2009 otorgado al trabajo realizado con mi alumna de doctorado (PhD) Luz Angela Alvarez. Evento: X Encuentro Nacional y III Internacional de Investigadores en las Ciencias Pecuarias. Título: “Diversidad genética y ancestría del ganado Hartón del Valle mediante ADN mitocondrial”. Sede: Medellín, Colombia, 23 de Octubre de 2009.

 

RECONOCIMIENTO EN CONGRESO DE BIOTECNOLOGÍA, 2008. El trabajo “Diversidad Mitocondrial de ganado Harton del Valle y sus relaciones con razas Bos taurus y Bos indicus” realizado por Alvarez, L.A., Muñoz, J.E., Barreto, G., Cárdenas, H y Vera, V recibió el reconocimiento como trabajo destacado en la modalidad de “Presentación Oral” en el III Congreso Colombiano de Biotecnología y II Seminario Internacional de Bionegocios, realizado en Bogotá, D.C., entre el 29 de Julio y el 1 de Agosto del 2008

 

PREMIO NACIONAL AL MEJOR TRABAJO EN EL AREA DE GENÉTICA Y BIOTECNOLOGÍA 2007.  Título “Factores Genéticos Asociados a Infertilidad Masculina: Microdeleciones del Cromosoma Y – Mutación ∆F508” realizado por Erazo Tatiana Ingrid, Gallego Lina Marcela, Corredor Zuray y Barreto Guillermo. Fue entregado en el marco del XLII Congreso Nacional de Ciencias Biológicas realizado en la ciudad de Barranquilla, entre el 9 y el 12 de Octubre de 2007.

 

PREMIO NACIONAL AL MEJOR TRABAJO EN EL AREA DE GENÉTICA Y BIOTECNOLOGÍA 2006. Título “Análisis de la diversidad y el grado de estructura genética presente en poblaciones humanas colombianas a partir del uso de marcadores RFLP´s de mtDNA” realizado por Fernando Rondón, Yamid Braga, Héiber Cárdenas y Guillermo Barreto. Fue entregado en el marco del XLI Congreso Nacional de Ciencias Biológicas realizado en la ciudad de Quibdó, entre el 10 y el 13 de Octubre de 2006.

 

PREMIO AGUILA EN LA CIENCIA 2005. Es la mayor distinción que la Asociación Colombiana de Ciencias Biológicas (ACCB) confiere a sus asociados. Fue entregado en el marco del XL Congreso Nacional de Ciencias Biológicas realizado en la ciudad de Cali, entre el 11 y el 14 de Octubre de 2005.

 

- PREMIO AL MEJOR TRABAJO EN EL IV CONGRESO INTERNACIONAL Y VII NACIONAL DE FERTILIDAD Y ESTERILIDAD 2005. Título “Frecuencia de microdelecciones en el brazo largo del cromosoma Y en pacientes con oligozoosermia y azoospermia idiopàtica en el suroccidente colombiano”. Autores Lina Marcela Gallego y Guillermo Barreto. Realizado en la ciudad de Cali del 21 al 23 de Septiembre de 2005

 

PREMIO NACIONAL AL MEJOR TRABAJO DE PREGRADO 2005. Realizado por mi alumna Zuray Corredor. Título: Determinación de la frecuencia de portadores de la mutación ΔF508 en tres grupos raciales del Suroccidente colombiano. XL Congreso Nacional de Ciencias Biológicas. Cali, 11 al 14 de Octubre de 2005.

 

IV. DISTINCIONES.

 

 

INVESTIGADOR SENIOR COLCIENCIAS. CONVOCATORIAS: 2013 - 2016. Reconocimiento especial de la Universidad del Valle al ser clasificado como investigador senior en el marco de la convocatoria No. 640 para Medición y Reconocimiento de Grupos de Investigación 2013 de Colciencias. Cali, 18 de Diciembre de 2014.

 

RECONOCIMIENTO ESPECIAL DE LA GOBERNACIÓN DEL VALLE DEL CAUCA. Resolución 0537 del Gobernador del Valle. Septiembre 15 de 2015.

 

RECONOCIMIENTO COMO “ILUSTRE EGRESADO INSTITUCIÓN EDUCATIVA BELISARIO PEÑA PIÑEIRO E HIJO DE ROLDANILLO-VALLE”. Resolución 071 de Rectoría del 18 de Septiembre de 2015.

 

CATEGORÍA A OTORGADA POR COLCIENCIAS AL GRUPO DE INVESTIGACIÓN “GENÉTICA MOLECULAR HUMANA” del cual soy su Director. Convocatorias de medición de grupos de Colciencias años: 2013 - 2016.

 

MAESTRO UNIVERSITARIO 2010. Otorgada por la Universidad del Valle mediante Resolución No. 030 del Consejo Superior de Mayo 13 de 2010.

 

ESTIMULO A INVESTIGADORES. Otorgado por Colciencias (convenio 101-95). Diciembre 29, 1995.

 

V.  BECAS RECIBIDAS

 

- Becario de la Organización de los Estados Americanos -OEA- para la realización de estudios de Magister en el Brasil. Beca número: F01661. Período: Marzo de 1987 - Marzo de 1989.

 

- Becario del gobierno brasilero por intermedio de la CAPES (“Comite de Aperfecioamento de Pessoal Docente de Nivel Superior”) para terminar el Magister. Período: Marzo de 1989 - Marzo de 1990.

 

- Becario del gobierno brasilero por intermedio del CNPq (“Conselho Nacional de Pesquisas do Brasil”) para la realización de Estudios de Doctorado. Período: Agosto de 1991 - Agosto de 1995.

 

Beneficiario del Programa “Retorno de Investigadores” de la Red Caldas de Colciencias. Junio de 1995.

 

VI. SOCIEDADES CIENTIFICAS

 

Regular Member. The American Society of Human Genetics.

Regular Member. European Society of Human Genetics.

Miembro Titular de la Sociedad Brasilera de Genética.

Sociedad Colombiana de Genética.

Asociación Colombiana de Ciencias Biológicas.

 

Redes:

 

Integrante por Colombia del Proyecto Genográfico, Módulo Sur América. Esta es una iniciativa de la National Geographic y la IBM.

 

VII.  ACTIVIDAD EN INVESTIGACION CIENTÍFICA

 

  1. Grupo de Investigación

 

Director del grupo de investigación en “Genética Molecular Humana” reconocido por Colciencias, código 0005412, y clasificado como categoría A. Se ocupa de la aplicación de las modernas técnicas de biología molecular a la caracterización de genes comprometidos con patologías hereditarias y al estudio de la diversidad genética humana (ver detalles en www.colciencias.gov.co/Scienti/GroupLAC).

 

  1. Líneas de Investigación.

 

Generación y  transferencia de tecnologías encaminadas al estudio del genoma humano

Caracterización de genes comprometidos con patologías hereditarias.

Estudio de la diversidad genética en poblaciones humanas.

Caracterización de la diversidad genética animal.

 

  1. c.      Dirección de estudiantes a nivel de postdoctorado.
    1. Dr. Nicolás Gutiérrez. Proyecto “Mecanismos genéticos de adaptación al entorno geográfico y predisposición a enfermedades en los indígenas colombianos y sus descendientes”. Período: 1/03/2015 -      .Realizó su PhD en Francia y regresó al país dentro de la convocatoria de Colciencias “Es Tiempo de Volver” con el objetivo de repatriar cerebros.

 

  1. Formacion de recursos humanos a nivel de postgrado.

 

Tesis de doctorado (PhD) dirigidas y terminadas.

 

6. Laura Jurado. 2015. Codirector.

 

5. Yamid Braga. Título tesis “Caracterización de la diversidad y la estructura genética amerindia del Sur-Oriente colombiano”. Inicia: Marzo 2010. Termina Abril 2015. Director. Defensa 25/04/2015.

Grado: 2015.

Comité Evaluador: Dres. Fabricio Rodigues dos Santos, UFMG, Brasil, Claudio Bravi IMBICI, Argentina y Felipe García, U. del Valle.

 

  1. Cristian Fong Reales. Título Tesis “Analisis molecular de la anemia falciforme y de la regulacion de hemoglobina fetal en pacientes de Colombia”. Director. Defensa 2 – 12 – 2013. Grado 2014.

 

  1. Estudiante Laura Cifuentes. Título tesis “Detección de mutaciones en los genes  BRCA1 y BRCA2 en pacientes con cáncer de mama familiar del Sur – Occidente cololombiano”. Grado 2011. Director.

 

  1. Estudiante: Fernando Rondón González.  Título de la tesis: “Estudio de la variabilidad genética en poblaciones humanas del centro y suroccidente colombiano mediante el uso de marcadores moleculares”. Grado: 2009. Director.

 

  1. Estudiante: Luz Angela Alvarez. Título tesis: “Diversidad genética del ganado Hartón del Valle y sus relaciones con Holstein y Brahman, mediante el uso de marcadores moleculares”. Grado: 2008. Codirector.

 

Tesis de Maestría dirigidas y terminadas

 

16. Gerardo David González Estrada.   Distribución alélica de genes relacionados con el rendimiento en deportistas élite del Valle del Cauca” Sustentación 19/08/2016. Director. Jurados Dres. Clara Inés Vargas UIS. Jaime Humberto Leyva Deantonio. U del Valle (Ed. Física).

 

15. Fabián Franco. “Variablilidad genética en poblaciones humanas indígenas del centro y suroccidente colombiano mediante el uso de marcadores ligados al cromosoma Y”. Sustentación17/03/2016. Director. Jurados Dres. Willian Usaquén y Andrés Castillo.

 

14. Ana Lucía Rivera. “Identificación de mutaciones en el exon 11 del gen BRCA2 asociadas con riesgo hereditario a cáncer de mama y/u ovario en Colombia”. Sustentación pública: 2015A. Director.

 

13. David Tróchez. “Identificación de mutaciones en exones del gen BRCA1 en pacientes colombianas con cáncer de mama hereditario”. Distinción: Meritoria  Sustentación pública 2015A. Director.

 

12. Delly Brigitte Tosse. DIVERSIDAD GENÉTICA EN TRES GRUPOS AMERINDIOS DEL SUR-OCCIDENTE COLOMBIANO. Sustentación pública Octubre de 2014.

 

11. Estudiante María Alejandra Lizarralde Iragorri. EVALUACIÓN MEDIANTE SNP´S DE REGIONES GENÓMICAS ASOCIADAS CON LA SEVERIDAD DE LA ANEMIA DE CÉLULAS FALCIFORMES. Sustentación Pública: Mayo de 2014. Distinción: Meritoria. Director.

 

10. Estudiante Vivian Andrea Perdomo. Título tesis “Análisis de polimorfismos asociados al gen de apolipoproteína E y su distribución en poblaciones del Sur Occidente y Centro colombiano”. Grado 2013. Director.

 

9. Estudiante Carolina Cortés Urrea. Título Tesis “Caracterización de mutaciones en el exón 11 del gen BRCA1 y asociación de las variantes XRCC3 T241M – RAD51 G135C en mujeres con cáncer de mama en Colombia”. Sustentación Pública: 24 Junio 2013. Grado: 2013. Director.

 

8. Estudiante Fabián Fellipe Fernández Daza. Título tesis: “Análisis de mutaciones en los genes 23S rRNA y pbp1A de aislados de Helicobacter pylori resistentes a Claritromicina y Amoxicilina, provenientes de Tumaco y Túquerres”. Grado 2013. Codirector.

 

7. Estudiante Julio César Osorio. “Identificación Molecular de Transcriptos Producto de la Translocación t(9;22)(q34;q11) en Pacientes con Leucemia Mieloide Crónica del Sur – Occidente Colombiano”. Grado 2012. Director.

 

6. Estudiante Leonardo Arias. Título tesis “Estudio de la Variación Genética en el ADN Mitocondrial de Nativos Americanos de la Amazonía Colombiana”. Grado 19 de Mayo 2012. Director.

 

5. Estudiante Zuray Fernanda Corredor. Título tesis “Determinación de la frencuencia de mutaciones en el gen CFTR en pacientes colombianos con fibrosis quística”. Grado 2011. Director.

 

4. Estudiante: Yamid Braga. Título tesis: “Diversidad genética de comunidades amerindias del Vaupés y el Guaviare mediante  STR’s, ADNmt y Y-STR’s”. Grado: 2009. Director.

 

3. Estudiante: Edna Lourdes Orozco Calambas. Título tesis: “Detección de mutaciones en el gen BRCA2 en familias con cáncer de mama del suroccidente colombiano. Grado: 2008. Director.

 

2. Estudiante: Lorena Cruz Bernate. Título tesis: “Relación entre patrones conductuales de defensa de nido y éxito reproductivo de vanellus chilensis (aves: charadriidae)  en el Valle del Cauca”, Grado 2006.  Co-director.

 

1. Estudiante: Francisco Villa. Título tesis: “Diferenciación entre poblaciones de Pimelodus clarias y Pimelodus Grosskopii (Siluriformes: Pimelodidae) en la cuenca del río Magdalena (Colombia)”. Francisco Villa. Grado 2002. Co-director.

 

VIII. PUBLICACIONES

 

  1. Artículos científicos.

 

Arias Leonardo, Barbieri Chiara, Barreto Guillermo, Stoneking Mark, Pakendorf Brigitte. 2017. High resolution mitochondrial DNA analysis sheds light on human diversity and population dynamics in Northwestern Amazonia. Sometido a american Journal of Physical Antropology.

 

Laura Cifuentes, Ana Lucía Riveray Guillermo Barreto. 2017. BRCA1 and BRCA2 mutations in breast and ovarian cancer families from Colombia. Breast Cancer and Treatment. Sometido a Colombia Médica.

 

Cristian Fong, Stephan Menzel, María Alejandra Lizarralde, Guillermo Barreto. 2015 Genetic variants associated with fetal hemoglobin levels show the diverse ethnic origin in Colombian patients with sickle cell anemia. Biomédica. 35(3): 437 – 443.

 

Diana Carolina Ortega, Cristian Fong, Héiber Cárdenas and Guillermo Barreto. 2015.  Evidence of over-dominance for sickle cell trait in a population sample from Buenaventura, Colombia. International Journal of Genetics and Molecular Biology 7(1): 1 – 7. DOI: 10.5897/IJGMB.20140106. ISSN: 2006-9863.

 

David M. Tróchez  Melissa Solarte  Carolina Cortés  Laura Cifuentes Guillermo Barreto. 2014. Polimorfismos en genes de baja penetrancia como marcadores genéticos de riesgo de cáncer de mama familiar entre mujeres colombianas. Polymorphisms of Low Penetrance Genes as Genetic Markers of Risk of Familial Breast Cancer among Colombian Women. Revista de Ciencias 18 (2): 51 -61. ISSN 0121-1935 (version impresa) ISSN 2248-4000 (version digital). iipresa121-1935

 

Nelson Rivera, Vivian Andrea Perdomo, Guillermo Barreto. 2015. Polymorphic frequencies of the apoliprotein E gene in Valle del Cauca, Colombia. Frecuencias polimórficas del gen de apolipoproteína “E” en el Valle del Cauca – Colombia. Revista de Ciencias. Revista de Ciencias 19 (1): 53-62. ISSN 0121-1935 (version impresa) ISSN 2248-4000 (version digital). iipresa121-1935

 

Diana Rojas-Gallardo, Guillermo Barreto. 2014. Diversidad y Estructura Genética de Tres Poblaciones Indígenas del Sur Occidente Colombiano. Rev. Asoc. Col. de Cienc Biol. (Col) 26: 72-78. ISSN: 0120-4173.

 

Laura Smeldy Jurado Medina,Marina Muzzio, Marisol Schwab, María Leticia Bravi Constantino, Guillermo Barreto and Graciela Bailliet. 2014. .Human Y- chromosome SNP characterization by Multiplex amplified product-length polymorphism analysis. Electrophoresis 35 (17): 2524-2527.     DOI: 10.1002/elps.201400020

 

Yherson Franchesco Molina Henao, Guillermo Barreto, Alan Giraldo. 2014. Implementation of  DNA mitochondrial analysis in Rhinoclemmys nasuta (Testudines: Geoemydidae). Acta Biológica Colombiana 19(3): 507 – 512.

 

Leslie A. Castillo Cutiva, Alan Giraldo, Guillermo Barreto. 2014. Genetic Diversity in a Population of Rhinoclemmys nasuta (Testudines:Geoemydidae) Associatted with an Insular Locality in the Chocó Biogeographic Region. Acta Biológica Colombiana 19(3): 513-519. ISSN  0120-548X.

 

Yamid Braga, Nelson Rivera,& Guillermo Barreto. 2014. Diversidad y estructura genética de poblaciones tucano oriental y kakua de la amazonía colombiana. Latin American Journal of Human Genetics 2 (1): 110 - 111.

 

Carolina Cortés, David Mauricio Tróchez, Melissa Solarte Cadavid, Daniela Gómez, Laura Cifuentes, Guillermo Barreto. 2014. Mutaciones en el gen BRCA1 en familias colombianas con cáncer de mama y/u ovario. Latin American Journal of Human Genetics 2 (1): 103 - 104.

 

Melissa Solarte Cadavid, David Mauricio Tróchez , Carolina Urrea, Guillermo Barreto. 2014. Alteraciones de secuencia en genes de baja penetrancia en pacientes con cáncer de mama familiar. Latin America Journal of Human Genetics 2 (1): 101.

 

Ana Lucía Rivera, Laura Cifuentes, Guillermo Barreto. 2014.  Identificación y análisis in silico del gen BRCA2 en familias colombianas con cáncer de mama/ovario. Latin America Journal of Human Genetics 2 (1): 98.

 

Oscar Sierra-Fitzgerald (q.e.p.d), Guillermo Barreto, Francisco Lopera-Restrepo. 2013. Ausencia de efecto cognitivo APOE en personas sanas de edad mediana. Acta Neurol Colomb 29(3): 163 – 172. ISSN 0120 8748

 

Lorena Cruz-Bernate, Yilton Riascos, & Guillermo Barreto. 2013. Dimorfismo sexual y determinación del sexo con DNA en el pellar común (Vanellus chilensis). Ornitología Neotropical 24: 433-444.

 

Cristian Fong, María Alejandra Lizarralde-Iragorri, Diana Rojas-Gallardo and Guillermo Barreto. 2013. Frequency and origin of haplotypes associated with the beta-globin gene cluster in individuals with trait and sickle cell anemia in the Atlantic and Pacific coastal regions of Colombia. Genetics & Molecular Biology 36 (4): 494-497.

 

Fernando Rondón González y Guillermo Barreto. 2013. Estructura genética, ancestralidad y su relación con los estudios en salud humana. Médicas UIS 26(1): 37 – 43. (ISSN 0121-0319 Impreso. ISSN 1794-5240 Web).

 

L. Cifuentes, C. Cortés, A. Rivera, G. Barreto. 2013. Identification of mutations associated with increased risk of hereditary breast and/or ovarian cancer in Colombia. Eur. J Hum Genet. 21 (Suppl. 2): 528 (J11.19) ESHG Conference. June 8-11, 2013. Paris,  France

 

Y. Mendoza, C. J. Fong, G. Barreto. 2013. Evaluation of SNP’s in promoter region of Gγ-globin gene and their relation with fetal hemoglobin in healthy individuals and sickle cell anemia patiens in Colombia. Eur. J Hum Genet 21 (Suppl. 2): 391. ESHG Conference. June 8-11, 2013. Paris,  France.

 

Joshua Mark Galanter, M.D.; Juan Carlos Fernandez; Christopher R. Gignoux; Jill Barnholtz-Sloan; Ceres Fernandez; Marc Via; Alfredo Hidalgo-Miranda; Alejandra V. Contreras; Laura Uribe Figueroa; Paola Raska; Gerardo Jimenez-Sanchez; Irma Silva Zolezzi; Maria Torres; Clara Ruiz Ponte; Yarimir Ruiz; Antonio Salas; Elizabeth Nguyen; Celeste Eng; Lisbeth Borjas; William Zabala; Guillermo Barreto….and Angel Carracedo 2012. 'Development of a Panel of Genome-Wide Ancestry Informative Markers to Study Admixture Throughout the Americas. PLoS Genetics 8(3) e1002554: 1-16. Cuartil Scimago Q1

 

Yamid Braga, Leonardo Arias B and Guillermo Barreto. 2012. Diversity and genetic structure analysis of three Amazonian Amerindian populations from Colombia. Colombia Médica 43(2): 134 – 141. Cuartil Scimago Q3.

 

Luz Angela Alvarez, Víctor J. Vera, Héiber Cárdenas, Guillermo Barreto y Jaime Muñoz. 2012. Assessing the genetic diversity and ancestry of Hartón del Valle Cattle using mitochondrial DNA. RCCP Revista Colombiana de Ciencias Pecuarias  25: 14 -26. Cuartil Scimago Q4

 

Guillermo Barreto, Carlos Armando Rodríguez, Yamid Andrés Braga, Melissa Quintero, Laura Jurado, Leonardo Arias, Ernesto León Rodríguez Fórez. 2010. Extracción y amplificación de ADN arqueológico de dos poblaciones prehispánicas del Suroccidente colombiano. International Journal of South American Archaeology 6: 46 – 57. (ISSN 2011-0626).

 

Sandra Guauque, Angela Patricia Fuentes-Pardo, Héiber Cárdenas-Henao y Guillermo Barreto. 2010. Diversidad y estructura genética de tres poblaciones afrodescendientes del suroccidente colombiano a partir de 8 STRs. Acta Biológica Colombiana 15 (2): 47 – 59.

 

L. Porras, C. Phillips, M. Fondevila, L. Beltra´n, T. Ortiz a, F. Rondon, Barreto, G.,  M.V. Lareu, J. Henao- A. Carracedo. 2009. Genetic variability of the SNPforID 52-plex identification-SNP panel in Central West Colombia. Forensic Science International: Genetics 4: e9 – e10. Cuartil Scimago Q4

 

Fernando Rondón, Julio César Osorio, Angela Viviana Peña, Héctor Andrés Garcés y Guillermo Barreto. 2008. Diversidad genética en poblaciones humanas de dos regiones colombianas. Colombia Médica 39 (2) (Supl. 2): 52 – 60.

 

Ingrid Tatiana Erazo, Lina Marcela Gallego, Zuray Fernanda Corredor y Guillermo Barreto. 2008. Prevalencia de microdeleciones en el cromosoma Yen una poblacion de pacientes con infertilidad masculina. Revista de la Asociación Colombiana de Ciencias Biológicas. 20: 164 – 172. ISSN 0120-4173

 

Luz Angela Alvarez, Jaime Eduardo Muñoz, Héiber Cárdenas, Guillermo Barreto y  Víctor Vera. 2008. Estudios de variabilidad en ganado criollo Hartón del Valle mediante el uso de marcadores moleculares. Seminario Internacional Perspectivas de Conservación. Mejoramiento y Utilización de Recursos Genéticos Criollos y Colombianos en los nuevos escenarios del mejoramiento animal. Pgs.115 – 127. Editores Durán, C.V. Campos, R. Editorial Universidad Nacional de Colombia. ISBN: 978-958-8095-44-8.

 

20. Fernando Rondón G, Yamid Braga, Héiber Cárdenas y Guillermo Barreto. 2007. Análisis de la diversidad y el grado de estructura genética presente en poblaciones humanas colombianas a partir del uso de marcadores RFLP´s de mtDNA. Revista de la Asociación Colombiana de Ciencias Biológicas 19: 94-103. ISSN 0120-4173.

 

Zuray Corredor, Juliana Escobar, Delly B. Tosse, Guillermo Barreto. 2006. Determinación de la frecuencia de portadores para la mutación ∆F508 en 3 grupos raciales del Sur-Occidente colombiano. Revista de la Asociación Colombiana de Ciencias Biológicas 18: 97-103. ISSN 0120-4173

 

Fernando Rondón, Rony Fernando Orobio, Yamid Andrés Braga, Héiber Cárdenas y Guillermo Barreto. 2006. Estudio de la diversidad genética de cuatro poblaciones aisladas del Centro y Sur-Occidente colombiano. Salud UIS 38 (1): 9– 15.  (ISSN 0121 – 0807)

 

Sandra Milena Guauque Olarte, Delly Brigitte Tosse y Guillermo Barreto. 2006. Niveles de expansión del trinucleótido CGG en el gen FMR-1 en pacientes con características fenotípicas del síndrome del X Frágil. Salud UIS 38 (1): 16 – 20. (ISSN 0121 – 0807)

 

Fernando Rondón González, Laura Cifuentes, Héiber Cárdenas y Guillermo Barreto. 2005. Evaluación de la diversidad genética mediante el análisis de mtDNA en poblaciones aisladas del Centro y Sur – Occidente colombiano. Salud Uninorte. 18: 75. ISSN 0120 – 5552.

 

Fernando Rondón González, Alba Marina Torres y Guillermo Barreto. 2005. Relaciones filéticas de comunidades indígenas colombianas a partir de la comparación de secuencias en el mtDNA y sus implicaciones en el doblamiento del contrinente americano. Salud Uninorte 18: 88. ISSN 0120 – 5552

 

Laura Cifuentes, Victoria Bonilla, Fernando rondón, Héiber Cárdenas y Guillermo Barreto. 2005. Evaluación de la diversidad genética mediante el análisis de STR´s en poblaciones aisladas del Centro y sur – Occidente colombiano. Salud Uninorte 18: 96. ISSN 0120 – 5552

 

Cifuentes, L., Bonilla, V., Cárdenas, H., Barreto, G. 2001. Análisis genético de diferentes grupos étnicos del Sur-Occidente colombiano mediante seis sitemas de STR´s. Acta Biológica Colombina 6 (2): 104-105. (ISSN 0120-548X)

 

Ramírez – Gómez, F., Rodríguez, Jorge., Barreto, G. 2001. PCR Múltiplo – SSCP – HA: una eficiente metodología para la detección de alteraciones de secuencia en el gen BRCA1. Acta Biológica Colombiana 6(2): 118. (ISSN 0120-548X)

 

Fernando Rondón, Gustavo Vallejo, Esteban Osorio, Guillermo Barreto. 1999. Frecuencias haplotípicas mitocondriales en la comunidad indígena Coyaima del departamento del Tolima, Colombia. Revista de la Asociación Colombiana de Ciencias Biológicas 11: 45 53.

 

Guillermo Barreto, Andrew J. Simpson y Sergio DJ Pena. 1996. LSSP-PCR: una nueva metodología para detectar alteraciones en la secuencia de nucleótidos del DNA. En: II Seminario Nacional de Biotecnología. Libro de Memorias. (Universidad del Tolima eds. ) Ibagué. Mayo 23-25. Pg. 21-23.

 

Barreto, .G., Vago, R.A., Simpson, A.J.G. & Pena, S.D.J. (1996) Mitochondrial D-Loop "signatures" produced by low-stringency single specific primer PCR (LSSP-PCR) constitute a simple and effective human identity test. The American Journal of Human Genetics. 58: 609-616.

 

Pena, S.D.J., Barreto, G., Vago, R. A., De Marco, L., Reinach, F.C., Dias Neto, E. & Simpson, A. 1994. Sequence-specific "gene signatures" can be obtained by PCR with single specific primers at low stringency. Proceedings of the National Academy of Sciences of the USA (PNAS) 91: 1946 - 1949.

 

 Pena, S.D.J., Barreto, G., Vago, R.A., Fuzikawa, A. & Simpson, A.D.J. LSSP- PCR: a novel approach to the recognition of DNA sequences and detection of point mutations. En: Miami Short Reports, Volume 4, Advances in Gene Technology: Molecular Biology and Human Disease (W.J. Whelan et al., eds) Oxford, IRL Press, pg 82, 1994.

 

Barreto G., Simpson, A.J.C., Ginther, C.L. & Pena, S.D.J. 1994. LSSP-PCR da alça-D do DNA mitocondrial humano: uma nova metodologia para a identificação de individuos. Revista Brasilera de Genética 17: C11.

 

Pena, S.D.J., Barreto, G., Ginther, C.L. & Simpson, A.J.G. (1993) Mitochondrial D-Loop "signatures" with low-stringency single specific primer PCR (LSSP-PCR): a novel approach to identity testing. En: Fourth International Symposium on Human identification. Manuscripts and Abstracts (Promega eds.) Scottsdale, Arizona, September 27-29. Pg. 59-62.

 

4. Pena, S.D.J., Barreto, G., Ginther, C.L. & Simpson, A.J.G. (1993) Mitochondrial D-Loop fingerprinting with low-stringency single specific primer PCR (LSSP-PCR): a novel approach to identity testing. The American Journal of Human Genetics 53 (Suppl.): 1210.

 

Barreto, G. & Salzano, F.M. (1992) Alu I and Hae III restriction endonucleases, human chromosomes and infertility. Revista Brasileira de Genética 15: 149-160.

 

Barreto, G & Jiménez, J.H. 1981. Incidencia de aberraciones cromosómicas en obreros expuestos ocupacionalmente al plomo y al cobre. Estudio Piloto. Actualidades Biológicas 10: 71-77.

 

b. Libros.

 

Edgardo Londoño Cruz, Jaime R. Cantera Kintz, Guillermo Barreto, Luz Angela López de Mesa, Fanny Lorena González, Alvaro Giraldo. Moluscos comunes del ecosistema rocoso marino del Pacífico colombiano. Una guía rápida para su identificación.  Programa Editorial Universidad del Valle. Cali, Octubre de 2013. ISBN 978-958-765-071-6

 

c. Capítulos de libros.

 

Capítulo de libro. Luz Angela Alvarez, Víctor Vera, Héiber Cárdenas, Guillermo Barreto, Jaime Eduardo Muñoz. 2008. Estudios de variabilidad en ganado criollo Hartón del Valle, mediante el uso de marcadores moleculares. En Durán, C.V.; Campos R. Editores. U. Nacional de Colombia, Sede Palmira. Perspectivas de conservación. Mejoramiento y utilización de recursos genéticos criollos colombianos en los nuevos escenarios del mejoramiento animal. Auros Copias, Cali, Colombia. p 115 – 127. ISBN 978-958-8095-44-8.

 

Barreto, G. 1992. Huellas digitales ("Fingerprints") de DNA y su aplicación en genética forense. En Gómez, P.A. Derecho de Familia. Temis, S.A. (ed.) Santafé de Bogotá. p. 449-454.

 

  1. b.     Presentación de trabajos en Congresos y Reuniones Científicas (20104-2016)

 

Conferencista invitado al “62ND BRAZILIAN – INTERNATIONAL CONGRESS OF GENETICS” donde dictó la palestra “DIVERSIDADE GENÉTICA DA POPULAÇÃO COLOMBIANA”. Caxambu, MG, Brasil. Septiembre 11-14, 2016.

 

Guillermo Barreto. 2016. Identificación de mutaciones en los genes BRCA1 y  BRCA2 asociadas con riesgo hereditario a cáncer de mama y/u ovario en Colombia. Ponenete en el XII Simposio Regional de Ciencias Básicas Biomédicas “Patología Molecular del Cáncer”. Sede: Facultad de Ciencias de la Salud, Universidad de Caldas. Manizales, 11 de Noviembre de 2016.

 

Cristian Javier Fong Reales, Diana Marcela Rojas-Gallardo, Guillermo Barreto. 2016. AUSENCIA DE RELACIÓN ENTRE LOS HAPLOTIPOS DE BETAGLOBINA Y LOS SINTOMAS ASOCIADOS A LA ANEMIA FALCIFORME EN PACIENTES DE COLOMBIA. Rev. Asoc. Col. Cienc. Biol. 28 (Suppl. 1): 35. ISSN 0120-4173. LI Congreso Nacional de Ciencias Biológicas. Armenia, Colombia. Octubre 18 -21, 2016.

 

Marisol Naydu Espitia Fajardo1, Nelson Rivera Franco, Yamid Andres Braga Gomez, Guillermo Barreto. 2016. DESCUBRIMIENTO Y VALIDACION DE NUEVOS Y-SNPs EN COMUNIDADES INDIGENAS DE COLOMBIA. Rev. Asoc. Col. Cienc. Biol. 28 (Suppl. 1): 93. ISSN 0120-4173. LI Congreso Nacional de Ciencias Biológicas. Armenia, Colombia. Octubre 18 -21, 2016.

 

Fabián Andrés Franco, Delly Brigitte Tosse y Guillermo Barreto. 2016. VARIABILIDAD GENÉTICA EN POBLACIONES INDÍGENAS DEL CENTRO Y SUROCCIDENTE COLOMBIANO MEDIANTE EL USO DE MARCADORES LIGADOS AL CROMOSOMA “Y”. Rev. Asoc. Col. Cienc. Biol. 28 (Suppl. 1): 99-100. ISSN 0120-4173. LI Congreso Nacional de Ciencias Biológicas. Armenia, Colombia. Octubre 18 -21, 2016.

 

Gerardo David González Estrada y Guillermo Barreto. 2016. Variantes genéticas relacionadas con el rendimiento deportivo en atletas élite del Valle del Cauca. XIV Congreso colombiano y VIII Congreso Internacional de Genética Humana. Bucaramanga 27 al 29 de Octubre de 2016

 

Luz Adriana García y Guillermo Barreto. 2016. ESTUDIO DE LA DIVERSIDAD Y ESTRUCTURA GENÉTICA DE LA POBLACIÓN AFRODESCENDIENTE DE CUATRO REGIONES DEL SUROCCIDENTE COLOMBIANO. XIV Congreso colombiano y VIII Congreso Internacional de Genética Humana. Bucaramanga 27 al 29 de Octubre de 2016.

 

Autores: Marisol Espitia, Nelson Rivera, Yamid Braga, Guillermo Barreto. 2016. RESOLUCIÓN FILOGENÉTICA DEL HAPLOGRUPO Q MEDIANTE VALIDACION DE NUEVOS Y-SNPs EN COMUNIDADES INDIGENAS DE COLOMBIA. XIV Congreso colombiano y VIII Congreso Internacional de Genética Humana. Bucaramanga 27 al 29 de Octubre de 2016.

 

Guillermo Barreto. 2015. Estudiando la diversidad genética humana en Colombia. Rev. Asoc. Col. Cienc. Biol. 27 (Suppl. 1): 21-22. ISSN 0120-4173. Simposio de Aguilas en la Ciencia. L Congreso Nacional de Ciencias Biológicas. Bucaramanga, Colombia. Octubre 6 -9, 2015.

 

Guillermo Barreto. 2015. Diversidad Genética de la población colombiana. Rev. Asoc. Col. Cienc. Biol. 27 (Suppl. 1): 232-233. ISSN 0120-4173. Simposio:

 Genética Poblacional Humana. L Congreso Nacional de Ciencias Biológicas. Bucaramanga, Colombia. Octubre 6 -9, 2015.

 

Yesica Mendoza Zambrano, Cristian Javier Fong Reales, Guillermo Barreto. 2015. EVALUACIÓN DE SNPs Y SU RELACIÓN CON LOS NIVELES DE HbF EN

INDIVIDUOS SANOS Y CON ANEMIA DE CÉLULAS FALCIFORMES EN COLOMBIA. Rev. Asoc. Col. Cienc. Biol. 27 (Suppl. 1): 83. ISSN 0120-4173. L Congreso Nacional de Ciencias Biológicas. Bucaramanga, Colombia. Octubre 6 -9, 2015.

 

Carolina Saavedra Díaz, Fabio Bonilla Abadía, Cristian Javier Fong Reales

Fabio Enrique Ospina Bocanegra , Guillermo Barreto. 2015. ASOCIACIÓN DE GENOTIPOS DEL SISTEMA DUFFY CON LA SEVERIDAD Y ACTIVIDAD DE LA ARTRITIS REUMATOIDE EN LA REGIÓN PACÍFICA COLOMBIANA. Rev. Asoc. Col. Cienc. Biol. 27 (Suppl. 1): 86. ISSN 0120-4173. L Congreso Nacional de Ciencias Biológicas. Bucaramanga, Colombia. Octubre 6 -9, 2015

 

Fabián Felipe Fernández, Mercedes Figueroa Macca, Guillermo Barreto, Armando Daniel Cortez Buelvas. 2014. Análisis de mutaciones en los genes 23S rRNA y pbp1A de aislados de Helicobacter pylori resistentes a Claritromicina y Amoxicilina, provenientes de Tumaco- Colombia. Hechos Microbiólicos 5 (2) Suplemento. 2. Pg. Noviembre, 2014. Memorias ISSN 2145-8898. Edit. Legis, S.A. XXII Congreso Latinoamericano de Microbiología y 4 Congreso Colombiano de Microbiología, Cartagena, Colombia, Nov. 5 – 8, 2014.

 

Yamid Braga, Nelson Rivera, & Guillermo Barreto. 2014. Diversidad y estructura genética de poblaciones Tucano Oriental y kakua de la amazonía colombiana. Latin America Journal of Human Genetics 2 (1): 110 - 111. XIII Congreso Colombiano de Genética Humana y VII Congreso Internacional de Genética Humana – Cali, Colombia, 3 -5 Septiembre,  2014.

 

Carolina Cortés, David Mauricio Tróchez, Melissa Solarte Cadavid, Daniela Gómez, Laura Cifuentes, Guillermo Barreto. 2014. MUTACIONES EN EL GEN BRCA1 EN FAMILIAS COLOMBIANAS CON CANCER DE MAMA Y/U OVARIO. Latin America Journal of Human Genetics 2 (1): 103 - 104. XIII Congreso Colombiano de Genética Humana y VII Congreso Internacional de Genética Humana – Cali, Colombia, 3 -5 Septiembre,  2014.

 

Melissa Solarte Cadavid, David Mauricio Tróchez , Carolina Urrea, Guillermo Barreto. 2014. ALTERACIONES DE SECUENCIA EN GENES DE BAJA PENETRANCIA EN PACIENTES CON CÁNCER DE MAMA FAMILIAR. Latin American Journal of Human Genetics 2 (1): 101. XIII Congreso Colombiano de Genética Humana y VII Congreso Internacional de Genética Humana – Cali, Colombia, 3 -5 Septiembre,  2014.

 

Ana Lucía Rivera, Laura Cifuentes, Guillermo Barreto. 2014.  Identificación y análisis in silico del gen BRCA2 en familias colombianas con cáncer de mama/ovario. Latin American Journal of Human Genetics 2 (1): 98. XIII Congreso Colombiano de Genética Humana y VII Congreso Internacional de Genética Humana – Cali, Colombia, 3 -5 Septiembre,  2014.

 

IX. PROYECCIÓN A LA COMUNIDAD.

 

El Servicio de Extensión en Genética Humana de la Universidad del Valle, que dirijo desde el año, 1996, utilizando la tecnología del ADN y profesionales formados al más alto nivel ofrece servicios de diagnóstico molecular de enfermedades genéticas, determinación de la paternidad y consejería genética.

 

X. CARGOS DESEMPEÑADOS.

 

Profesor Titular, Sección de Genética, Departamento de Biología. Universidad del Valle. Agosto de 1995 – hasta la fecha.

 

Director Postgrado en Ciencias – Biología (niveles Maestría y Doctorado).

Enero 2008– Marzo 2011. Universidad del Valle.

 

Profesor Visitante, Univesidad Nacional Mayor de San Marcos, Centro de Investigación de Bioquímica y Nutrición. Lima - Perú. Curso Ministrado ¨Métodologías de extracción y amplificación de DNA¨. Período: 15 al 27 de Noviembre de 1993.

 

Director Servicio de Extensión en Genética Humana. Sección Genética, Facultad de Ciencias Naturales y Exactas. Universidad del Valle. 1996 – Hoy.

 

XI. IDIOMAS.

 

Español, Portugués e Inglés.

 

Citas

Aitken, N., Smith, S., Schwarz, C. & Morin, P. A. (2004). Single nucleotide polymorphism (SNP) discovery in mammals: a targeted-gene approach. Mol Ecol. 13 (6): 1423-1431.

Arango, R. & Sánchez, E. (2004). Los pueblos indígenas de Colombia en el umbral del nuevo milenio: población, cultura y territorio, bases para el fortalecimiento social y económico de los pueblos indígenas. Bogotá D.C. Colombia Departamento Nacional de Planeación, Dirección de Desarrollo Territorial Sostenible.

Bandelt, H. J., Forster, P. & Röhl, A. (1999). Median-joining networks for inferring intraspecific phylogenies. UMol Biol Evol. 16 (1): 37-48.

Barrantes, R., Smouse, P. E., Mohrenweiser, H. W., Gershowitz, H., Azofeifa, J., Arias, T. D. & Neel, J. V. (1990). Microevolution in lower Central America: genetic characterization of the Chibcha-speaking groups of Costa Rica and Panama, and a consensus taxonomy based on genetic and linguistic affinity. Am J Hum Genet. 46 (1): 63-84.

Battaglia, V., Grugni, V., Perego, U. A., Angerhofer, N., Gomez Palmieri, J. E., Woodward, S. R., Achilli, A., Myres, N., Torroni, A. & Semino, O. (2013). The First Peopling of South America: New Evidence from Y-Chromosome Haplogroup Q. Plos One. 8 (8): e71390. Recuperado de https:// journals.plos.org/plosone/.

Bortolini, M. C., Salzano, F. M., Thomas, M. G., Stuart, S., Nasanen, S. P. K., Bau, C. H. D., Hutz, M. H., Layrisse, Z., Petzl Erler, M. L., Tsuneto, L. T., Hill, K., Hurtado, A. M., Castro-De- uerra, D., Torres, M. M., Groot, H., Michalski, R., Nymadawa, P., Bedoya, G., Bradman, N., Labuda, D. & Ruiz-Linares, A. (2003). Y-chromosome evidence for differing ancient demographic histories in the Americas. Am J Hum Genet. 73 (3): 524-539.

Braga, Y., Arias, B. L. & Barreto, G. (2012). Diversity and genetic structure analysis of three amazonian amerindian populations of Colombia. Col Med. 43 (2): 133-140.

Braga, Y. A. (2015). Caracterización de la diversidad y la estructura genética amerindia del sur-oriente colombiano (Tesis Doctoral). Universidad del Valle. Cali.

Carvajal-Carmona, L. G., Soto, I. D., Pineda, N., OrtízBarrientos, D., Duque, C., Ospina-Duque, J., McCarthy, M., Montoya, P., Alvarez, V. M., Bedoya, G. & RuizLinares, A. (2000). Strong Amerind/white sex bias and a possible Sephardic contribution among the founders of a population in northwest Colombia. Am J Hum Genet. 67 (5): 1287-1295.

Colombia. Departamento Administrativo Nacional de Estadística. (2007). Colombia una nación multicultural: su diversidad étnica. Manuscrito inédito. Recuperado de https://www.dane.gov.co/files/censo2005/etnia/sys/colombia_nacion.pdf

Criollo-Rayo, Á. A. (2012). Caracterización molecular de la variación genética en cuatro etnias indígenas (Pijao, Páez, Emberá y Zenú) y dos poblaciones mestizas de Colombia (Tolima y Córdoba) mediante marcadores del mADN, NRY y AIMs (Tesis de Maestría). Universidad del Tolima. Ibagué.

Díaz, L. F. (2010). Análisis de 17 loci de STR de cromosoma Y en las poblaciones de Bogotá y Santander con fines genéticopoblacionales y forenses (Tesis de Maestría). Pontificia Universidad Javeriana. Bogotá D.C.

Dow, D. & Karunaratna, A. (2006). Developing a multidimensional instrument to measure psychic distance stimuli. J Int Bus Stud. 37 (5): 578-602.

Excoffier, L. & Lischer, H. E. (2010). Arlequin suite ver 3.5: A new series of programs to perform population genetics analyses under Linux and Windows. Mol Ecol Res. 10 (3): 564-567.

Franco, C. F. A. (2016). Variabilidad genética en poblaciones humanas indígenas del centro y suroccidente colombiano mediante el uso de marcadores ligados al cromosoma Y (Tesis de Maestría). Universidad del Valle. Cali.

Geppert, M., Ayub, Q., Xue, Y., Santos, S. B., Ribeiro-DosSantos, A., Baeta, M., Núñez, C., Martínez-Jarreta, B., Tyler–Smith, C. & Roewer, L. (2015). Identification of new SNPs in native South American populations by resequencing the Y chromosome. Forensic Sci Int: Genet. 15: 111-114.

Geppert, M., Baeta, M., Núñez, C., Martínez-Jarreta, B., Zweynert, S., Vacas-Cruz, O. W., González-Andrade, F., González-Solorzano, J., Nagya, M. & Roewer, L. (2011).

Hierarchical Y-SNP assay to study the hidden diversity and phylogenetic relationship of native populations in South America. UForensic Sci Int: Genet. 5 (2): 100-104.

Gómez, A., Ávila, S. J. & Briceño, I. (2008). De genotipos e isonimias: análisis de correlación entre el apellido y el patrimonio genético heredado en el cromosoma Y en la población de tres departamentos del suroccidente colombiano. Biomédica. 28 (3): 357-370.

ISOGG, International Society of Genetic Genealogy (2015). Y-ADN Haplogroup Tree 2015. Manuscrito inédito. Recuperado de http://www.isogg.org/tree/

Karafet, T. M., Mendez, F. L., Meilerman, M. B., Underhill, P. A., Zegura, S. L. & Hammer, M. F. (2008). New binary polymorphisms reshape and increase resolution of the human Y chromosomal haplogroup tree. Genome Res. 18 (5): 830-838.

Kayser, M., Roewer, L., Hedman, M., Henke, L., Henke, J., Brauer, S., Krüger, C., Krawczak, M., Nagy, M., Dobosz, T., Szibor, R., De-Knijff, P., Stoneking, M. & Sajantila, A. (2000). Characteristics and frequency of germline mutations at microsatellite loci from the human Y chromosome, as revealed by direct observation in father/ son pairs. Am J Hum Genet. 66 (5): 1580-1588.

Keyeux, G., Rodas, C., Gelvez, N. & Carter, D. (2002). Possible migration routes into South America deduced from mitochondrial DNA studies in Colombian Amerindian populations. Hum Biol. 74(2): 211-233.

Kloosterman, J. (1997). Identidad indígena, entre romanticismo y realidad. Quito, Ecuador. Ediciones Abya-Yala. Lewis, M. P., Simons, G. F. & Fennig, C. D. (2014). Ethnologue: Languages of the World. Manuscrito inédito. Recuperado de http://www.ethnologue.com/

Malyarchuk, B., Derenko, M., Denisova, G., Maksimov, A., Wozniak, M., Grzybowski, T., Dambueva, I. & Zakharov, I. (2011). Ancient links between Siberians and Native Americans revealed by subtyping the Y chromosome haplogroup Q1a. J Hum Genet. 56 (8): 583-588.

Mesa, N. R., Mondragón, M. C., Soto, I. D., Parra, M. V., Duque, C., Ortíz-Barrientos, D., García, L. F., Velez, I. D., Bravo, M. L., Múnera, J. G., Bedoya, G., Bortolini, M. C. & Ruiz-Linares, A. (2000). Autosomal, mtDNA and Y Chromosome Diversity in Amerinds: Pre- and PostColumbian Patterns of Gene Flow in South America. Am J Hum Genet. 67 (5): 1277-1286.

Miller, S. A., Dykes, D. D. & Polesky, H. F. (1988). A simple salting out procedure for extracting ADN from human nucleated cells. UNucleic Acids Res. 16 (3): 1215.

Mulligan, C. J., Hunley, K., Cole, S. & Long, J. C. (2004). Population genetics, history, and health patterns in native americans. UAnnu Rev Genomics Hum Genet. 5: 295-315.

Novembre, J & Ramachandran, S. (2011). Perspectives on human population structure at the cusp of the sequencing era. Annu Rev Genomics Hum Genet. 12: 245-274.

Peakall, R. & Smouse, P. E. (2012). GenAlEx 6.5: genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research—an update. Bioinformatics. 28 (19): 2537-2539.

Pontes, M. L., Abrantes, D., Lima, G., Cainé, L., Pereira, M. J., Matos, P. & Pinheiro, F. (2006). AmpFℓSTR Y-filer: A new tool for rapid Y-STR forensic haplotyping. UInt Congress Series. 1288:180-182.

R Development Core Team. (2015). R: A language and environment for statistical computing. Vienna, Austria. R Foundation for Statistical Computing. Recuperado de http://www.R-project.org

Rodas, C., Gelvez, N. & Keyeux, G. (2003). Mitochondrial DNA studies show asymmetrical amerindian admixture in afrocolombian and mestizo populations. Hum Biol. 75 (1): 13-30.

Rondón, F., Vallejo, G., Osorio, E. & Barreto, G. (1999). Frecuencias haplotípicas mitocondriales en la comunidad indígena Coyaima del departamento del Tolima, Colombia. Rev Asoc Col Ciencias Biol.11: 45-53.

Rondón, F. (2009). Estudio de la variabilidad genética en poblaciones humanas del centro y suroccidente colombiano, mediante el uso de marcadores moleculares (Tesis Doctoral). Universidad del Valle. Cali.

Roewer, L., Nothnagel, M., Gusmão, L., Gomes, V., González, M., Corach, D., Sala, A., Alechine, E., Palha, T., Santos, N., Ribeiro- os-Santos, A., Geppert, Maria; Willuweit, Sascha; Nagy, Marion; Zweynert, Sarah; Baeta, Miriam; Núñez, C., Martínez, B., González, F., Fagundes, E., Aparecida, D., Builes, J., Turbón, D., Lopez, A., Arroyo, E., Toscanini, U., Borjas, L., Barletta, C., Ewart, E., Santos, S. & Krawczak, M. (2013). Continent-wide decoupling of Y-chromosomal genetic variation from language and geography in native South Americans. Plos Genetic. 9 (4): e1003460. Recuperado de https://journals.plos.orgplosgenetics/

Sandoval, J., Lacerda, D., Jota, M., Salazar, A., Vieira, P., Acosta, O., Cuellar, C., Revollo, S., Fujita, R., Santos, F. & The Genographic Project Consortium. (2013). The genetic history of indigenous populations of the peruvian and bolivian altiplano: the legacy of the Uros. Plos One. 8 (9): e73006. Recuperado de https://journals.plos.org/plosone/

Sun, G., Mcgarvey, S. T., Bayoumi, R., Mulligan, C. J., Barrantes, R., Raskin, S., Zhong, Y., Akey, J., Chakraborty, R. & Deka, R. (2003). Global genetic variation at nine short tandem repeat loci and implications on forensic genetics. European Journal of Human Genetics. 11 (1): 39-49.

Tamura, K., Stecher, G., Peterson, D., Filipski, A. & Kumar, S. (2013). MEGA6: Molecular Evolutionary Genetics Analysis version 6.0. UMol Biol Evol. 30 (12): 2725-2729.

Tosse, D. B. (2014). Diversidad genética en tres grupos amerindios del suroccidente Colombiano (Tesis de Maestría). Universidad del Valle. Cali.

Vidal, M. (2011). Cómo clasificar las clasificaciones IV, El gran reto: un dendrograma de todas las lenguas. Punto y coma. 123 (5): 35-45.

Xavier, C., Builes, J. J., Gomes, V., Ospino, J. M., Aquino, J., Parson, W., Amorim, A., Gusmão, L. & Goios, A. (2015). Admixture and genetic diversity distribution patterns of non-recombining lineages of Native American ancestry in Colombian populations. Plos One. 10 (3): e0120155. Recuperado de https://journals.plos.org/plosone/

Zegura, S. L., Karafet, T. M., Zhivotovsky, L. A. & Hammer, M. F. (2004). High-resolution SNPs and microsatellite haplotypes point to a single, recent entry of native american Y chromosomes into the Americas. Mol Biol Evol. 21 (1): 164-175.

Publicado
2017-10-09
Cómo citar
Franco, F. A., & Barreto, G. (2017). Estructura genética de poblaciones indígenas del occidente colombiano mediante el uso de marcadores ligados al cromosoma Y. Revista De La Academia Colombiana De Ciencias Exactas, Físicas Y Naturales, 41(160), 281-291. https://doi.org/10.18257/raccefyn.476
Sección
Ciencias biomédicas