El análisis genético de paleo-colombianos de Nemocón, Cundinamarca proporciona revelaciones sobre el poblamiento temprano del Noroeste de Suramérica

Marcela Díaz-Matallana, Alberto Gómez Gutiérrez, Ignacio Briceño, José Vicente Rodríguez Cuenca

Resumen


El sitio Checua localizado en Nemocón en la Región de los Andes Orientales Colombianos, ha mostrado evidencia de actividades de cazadores-recolectores desde 9500-8700 cal AP. El objetivo de este trabajo fue analizar genéticamente el grupo Checua mediante datos de secuencia de ADN mitocondrial HVR-I. Siguiendo criterios estrictos de autenticidad para los estudios de ADN antiguo, se extrajo, se amplificó y se secuenció el ADN para cada uno de los restos humanos disponibles. Doce de los 22 restos humanos de Checua se evaluaron con éxito (54,54%) en este trabajo. Los Paleo-Colombianos Checua revelaron los haplogrupos nativos americanos A2, B2 y C1, además del raro haplogrupo D4h3a, reportado por primera vez en Colombia antigua. La comparación de los datos genéticos entre los Paleo-Americanos y Colombia moderna demuestra la continuidad de los haplogrupos A2, B2 y C1, y una probable discontinuidad de D4h3a desde tiempos prehistóricos en Colombia, si no una escasez de registros de D4h3a en la literatura y/o bases de datos, mientras que D1 está presente en Colombia actual. La presencia de los haplogrupos D4h3a, A2, B2, y C1 en entierros Colombianos del Holoceno temprano apoya la evidencia genética para dispersiones de Paleo-americanos hacia abajo por la costa del Pacífico. Nuestros datos Paleo-genéticos de Colombia, junto con otros datos genéticos, arqueológicos y paleoambientales publicados, nos permiten proponer un Modelo Integrado de Migración para el poblamiento temprano del Noroeste de Suramérica, que involucró diferentes movimientos: (1) Norte a Sur a lo largo de la costa; (2) Oeste a Este a través de las Cordilleras Andinas; (3) Descubrimiento fluvial y colonización de sus riberas. © 2016. Acad. Colomb. Cienc. Ex. Fis. Nat. Todos los derechos reservados.


Palabras clave


Sitio Checua; Ocupación de cazadores-recolectores; Paleo-ADN; ADN mitocondrial (ADNmt); Cundinamarca; Colombia, olas de migración.

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Referencias


Aceituno, F.J., Loaiza, N., Delgado-Burbano, M.E., Barrientos, G. 2013. The initial human settlement of Northwest South America during the Pleistocene/Holocene transition: Synthesis and perspectives. Quat. Int. 301: 23-33.

Achilli, A., Perego, U.A., Bravi, C.M., Coble, M.D., Kong, Q.P., Woodward, .R., et al. 2008. The phylogeny of the four Pan-American mtDNA haplogroups: Implications for evolutionary and disease studies. PLoS One. 3 (3): e1764.

Aguirre-Licht, D. 2006. Choco Languages. In: K. Brown (editor). Encyclopedia of Language and Linguistics. Elsevier, Amsterdam. p. 367-381.

Aikhenvald, A. 1999. Arawak. In: R.M.W. Dixon, A. Aikhenvald (editors). The Amazonian Languages. Cambridge University Press. p. 65-106.

Andrews, R.M., Kubacka, I., Chinnery, P.F., Lightowlers, R.N., Turnbull, D.M., Howell, N. 1999. Reanalysis and revision of the Cambridge reference sequence for human mitochondrial DNA. Nat. Genet. 23 (2): 147.

Bandelt, H.J., Forster, P., Rohl, A. 1999. Median-Joining networks for inferring intraspecific phylogenies. Mol. Biol. Evol. 16 (1): 37-48.

Batista, O., Kolman, C., Bermingham, E. 1995. Mitochondrial DNA diversity in the Kuna Amerinds of Panama. Hum. Mol. Genet. 40: 921-929.

Bodner, M., Perego, U.A., Huber, G., Fendt, L., Röck, A.W., Zimmermann, B., et al. 2012. Rapid Coastal spread of First Americans: Novel Insights from South America´s Southern Cone mitochondrial genomes. Genome Res. 22: 811-820.

Bolnick D.A. 2005. The genetic prehistory of eastern North America: Evidence from ancient and modern DNA (Ph.D. Dissertation- nthropology). University of California-Davis, USA.

Bolnick DA, Bonine HM, Mata-Míguez J, Kemp BM, Snow MH, Leblanc S. 2012. Nondestructive sampling of human skeletal remains yields ancient nuclear and mitochondrial DNA. Am. J. Phys. Anthropol. 147: 293-300.

Bryan, A.L., Casamiquela, R.M., Cruxent, J.M., Gruhn, R., Ochsenius, C. 1978. An El Jobo Mastodon Kill at Taima-taima, Venezuela. Science. 200 (4347): 1275-1277.

Bryc, K., Vélez, C., Karafet, T., Moreno-Estrada, A., Reynolds, A., Auton, A., et al. 2010. Genome-wide patterns of population structure and admixture among Hispanic/Latino populations. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 107 (2): 8954-8961.

Cardoso S, Palencia-Madrid L, Valverde L, Alfonso-Sánchez MA, Gómez-Pérez L, Alfaro E, et al. 2013. Mitochondrial DNA control region data reveal high prevalence of Native American lineages in Jujuy province, NW Argentina. Forensic Sci. Int. Genet. 7: e52-e55.

Carvajal, E., Montes, L., Almanza, O.A. 2014. Datación de restos arqueológicos encontrados en Checua (Cundinamarca-Colombia) mediante Resonancia Paramagnética Electrónica. Rev. Acad. Col. Cienc. 38 (147): 124-129.

Casas-Vargas, A., Gómez, A., Briceño, I., Díaz-Matallana, M., Bernal, J.E., Rodríguez, J,V. 2011. High genetic diversity on a sample of pre-olumbian bone remains from Guane territories in northwestern Colombia. Am. J. Phys. Anthropol. 146: 637-649.

Catelli, M.l., Álvarez-Iglesias, V., Gómez-Carballa, A., Mosquera-Miguel, A., Romamini, C., Borosky, A., et al. 2011. The Impact of modern migrations on present-day multi-ethnic Argentina as recorded on the mitochondrial DNA genome. BMC Genet. 12: 77.

Chatters, J.C., Kenneth, D.J., Asmeron, Y., Kemp, B.M., Polyak, V., Blank, A.N., et al. 2014. Late Pleistocene human skeleton and mtDNA link Paleoamericans and modern Native Americans. Science. 344 (6185): 750-754.

Constenla-Umaña, A. 2005. ¿Existe relación genealógica entre lenguas misumalpas y chibchenses? Estudios de Lingüística Chibcha. 24: 7-85.

Cooke R, Ranere A, Pearson G, Dickau R. 2013. Radiocarbon chronology of early human settlement on the Isthmus of Panama (13,000-7,000 BP) with comments on cultural affinities, environments, subsistence, and technological change. Quat. Int. 301: 3-22.

Cooper, A., Poinar, H.N. 2000. Ancient DNA: Do it Right or Not at All. Science. 289 (5482): 1139.

Correal, G., Van der Hammen, T., Lerman, L.C. 1970. Artefactos líticos de abrigos rocosos en el Abra, Colombia. Rev. Colomb. Antropol. 14: 9-53.

Correal, G. 1990. Evidencias culturales durante el Pleistoceno y Holoceno de Colombia. Rev. Arqueol. Americana. 1: 33-68.

Correal, G. 1993. Nuevas Evidencias culturales Pleistocénicas y Megafauna en Colombia. Boletín de Arqueología. 8 (1): 3-12.

Cui, Y., Lindo, J., Hughes, C.E., Johnson, J.W., Hernandez, A.G., Kemp, B.M., et al. 2013. Ancient DNA analysis of Mid-Holocene individuals from the Northwest coast of North America reveals different evolutionary aths for mitogenomes. PLoS One. 8 (7): e66948.

de la Fuente, C., Galimany, J., Kemp, B., Judd, K., Reyes, O., Moraga, M. 2014. Cazadores recolectores australes: Aproximación a la historia poblacional de grupos canoeros de Patagonia y Tierra del Fuego. XIII Congreso Asociación Latinoamericana de Antropología Biológica (ALAB). Santiago de Chile.

de Saint-Pierre, M., Bravi, C.M., Motti, J.M., Fuku, N., Tanaka, M., Llop, E., et al. 2012. An alternative model for the Early Peopling of Southern South America revealed by analyses of three mitochondrial DNA haplogroups. PLoS One. 7 (9): e43486.

Díaz-Matallana, M. 2009. In search of pre-Columbian migrations to the Caribbean: Indigenous Mitochondrial DNA from northern South America (M.Sc. Thesis - Biology). University of Puerto Rico-Mayaguez, PR. ProQuest. 88p.

Díaz-Matallana, M., Martínez-Cruzado, J.C. 2010. Estudios sobre ADN mitocondrial sugieren un linaje predominante en la Cordillera Oriental de Colombia y un vínculo Suramericano para los arcaicos de Puerto Rico. Universitas Médica. 51 (3): 241-272.

Díaz-Matallana, M., Briceño, I., Borda-Camacho, E., Gómez, A., Bernal, J.E., Rodríguez, J.V. 2010. Uso de imágenes diagnósticas para el estudio de una momia proveniente de San José de Suaita, Santander (Colombia). XI Congreso Asociación Latinoamericana de Antropología Biológica (ALAB). Facultad Ciencias Humanas, Universidad Nacional de Colombia, Bogotá.

Díaz-Matallana, M., Briceño, I., Borda-Camacho, E., Gómez, A., Bernal, J.E., Rodríguez, J.V. 2014. Molecular characterization of early Holocene skeletal human remains belonging to Checua culture from Colombia- outh America. 22nd Annual Meeting, Society for Molecular Biology & Evolution (SMBE). San Juan, Puerto Rico (USA).

Díaz-Matallana, M. 2015. Caracterización Genética de un grupo Paleoamericano Checua proveniente de Nemocón- Cundinamarca, Colombia: Implicaciones para el Poblamiento Temprano de Suramérica (Tesis Ph.D. Ciencias Biológicas). Pontificia Universidad Javeriana. Bogotá. 104 p.

Dillehay, T.D. 1999. The Late Pleistocene culture of South America. Evol. Anthropol. 7 (6): 206-216.

Dillehay, T.D., Ramírez, C., Pino, M., Collins, M.B., Rossen, J., Pino-Navarro, J.D. 2008. Monte Verde: Seaweed, food, medicine, and the peopling of South America. Science. 320: 784-786.

Dillehay, T.D., Bonavia, D., Goodbred Jr, S.L., Pin, M., Vásquez, V., Rosales-Tham, T. 2012. A late Pleistocene human presence at Huaca Prieta, Perú, and early Pacific Coastal adaptations. Quat. Res. 77: 418-423.

Emery, L.S., Magnaye, K.M., Bigham, A.W., Akey, J.M., Bamshad, M.J. 2015. Estimates of Continental Ancestry vary widely among Individuals with the same mtDNA Haplogroup. Am. J. Hum. Genet. 96: 183-193.

Eshleman, J.A., Smith, D.G. 2001. Use of DNAse to eliminate contamination in ancient DNA analysis. Electrophoresis. 22: 4316-4319.

Fagundes, N.J.R., Kanitz, R., Eckert, R., Valls, A.S., Bogo, M.R., Salzano, F.M., et al. 2008. Mitochondrial population genomics supports a single Pre-Clovis origin with a coastal route for the Peopling of the Americas. Am. J. Hum. Genet. 82: 583-592.

Faltyskova, Z., et al. 2014. Population history of South America: ancient DNA study of extinct people from Tierra del Fuego. 22nd Annual Meeting, Society for Molecular Biology & Evolution (SMBE). San Juan, Puerto Rico (USA).

Fehren-Schmitz, L., Reindel, M., Cagigao, E., Hummel, S., Herrmann, B. 2010. Pre-Columbian population dynamics incoastal Southern Peru: A Diachronic Investigation of mtDNA patterns in the Palpa Region by ancient DNA Analysis. Am. J. Phys. Anthropol. 141: 208-221.

Fernández, C. 1999. La arqueología molecular aplicada a la solución de problemas prehistóricos: análisis de ADNmt en momias y restos óseos prehispánicos (Tesis pregrado-Antropología). Universidad Nacional de Colombia, Bogotá.

Figueiro, G., Sans, M. 2007. Primeros resultados del análisis de ADN Mitocondrial del Sitio Arroyo Seco 2, Buenos Aires, Argentina. Rev. Arg. Antropol. Biol. 9 (1): 78.

Fix, A.G. 2005. Rapid deploymentof the five founding Amerind mtDNA haplogroups via coastal and riverine colonization. Am. J. Phys. Anthropol. 128: 430-436.

Fontugne, M. 2013. New Radiocarbon Ages of Luzia woman, Lapa Vermelha IV site, Lagoa Santa, Minas Gerais, Brazil. Radiocarbon. 55 (2-3): 1187-1190.

Fu, Y.X. 1997. Statistical tests of neutrality of mutations against population growth, hitch-hiking, and background selection. Genetics. 47: 915-925.

Fuselli, S., Tarazona-Santos, E., Dupanloup, I., Soto, A., Luiselli, D., Pettener, D. (2003). Mitochondrial DNA Diversity in South America and the genetic history of Andean highlanders. Mol. Biol. Evol. 20: 1682-691.

Goebel, T., Waters, M.R., O’Rourke, D.H. 2008. The Late Pleistocene dispersal of modern humans in the Americas. Science. 319: 1497-1502.

González, J.R., Neves, W.A., Lahr, M.M., González, S., Pucciarelli, H., Hernández-Martínez, M., et al. 2005. Late Pleistocene/Holocene craniofacial morphology in Mesoamerican Paleoindians: Implications for the peopling of the New World. Am. J. Phys. Anthropol. 128: 772-780.

Greenberg, JH, Turner, C.G. II, Zegura, S.L. 1986. The settlement of the Americas: a comparison of the linguistic, dental and genetic evidence. Curr. Anthropol. 27: 477-497.

Groot, A.M. 1992. Checua: Una secuencia cultural entre 8,500 y 3,000 años Antes del Presente. Bogotá: Fundación Investigaciones Arqueológicas, Banco de La República; 100p.

Groot, A.M. 1995. Checua: Un aporte para el conocimiento del precerámico de la sabana de Bogotá. En: I. Cavelier, S. Mora (editores). Ámbito y Ocupaciones Tempranas de la América Tropical. Instituto Colombiano de Antropología, Bogotá.

Groot, A.M. 2006. Arqueología y Patrimonio: Conocimiento y Apropiación Social. Rev. Acad. Col. Cienc. 30 (114): 5-17.

Gruhn, R. 1994. The Pacific Coast route of initial entry: An overview. In: R. Bonnichsen, D.G. Steele (editors). Method and theory for investigating the peopling of the Americas. Oregon State University, Corvallis, USA. p. 34-44.

Jara, N.P. 2007. Determinación de la estructura genética en un grupo poblacional Muisca mediante el análisis de polimorfismos en el ADNmt (Tesis Maestría-Biología). Facultad Ciencias, Pontificia Universidad Javeriana, Bogotá.

Jenkins, D.L, Davis, L.G., Stafford, T.W. Jr., Campos, P.L., Conolly, T.J., Cummings, L.S., et al. 2008. Geochronology, Archaeological Context, and DNA at the Paisley Caves. In: K.E. Graf, C.V. Ketron, M.R. Waters (editors). The Paleoamerican Odyssey. College Station, Center for the Study of First Americans, USA. p. 485-520.

Johnson, J.R., Stafford, T.W. Jr., Ajie, H.O., Morris, D.P. 2002. Arlinton Springs Revisited. In: D.R. Brooks, K.C. Mitchell, H.W. Channey (editors). Santa Barbara Museum of Natural History, California, USA. p. 541-545.

Kemp, B.M., Smith, D.G. 2005. Use of bleach to eliminate contaminating DNA from the surfaces of bones and teeth. Forensic Sci. Int. 54: 53-61.

Kemp, B.M., Malhi, R.S., Mcdonough, J., Bolnick, D.A., Eshleman, J.A., Rickards, O., et al. 2007. Genetic analysis of Early Holocene skeletal remains from Alaska and its Implications for the settlement of the Americas. Am. J. Phys. Anthropol. 132: 605-621.

Kemp, B.M., Tung, T.A., Summar, M.L. 2009. Genetic continuity after the collapse of the Wari Empire: mitochondrial DNA profiles from Wari and post-Wari populations in the ancient Andes. Am. J. Phys. Anthropol. 140: 80-91.

Keyeux, G., Rodas, C., Gelvez, N., Carter, D. 2002. Possible migration routes into South America deduced from mitochondrial DNA studies in Colombian Amerindian populations. Hum. Biol. 74 (2): 211-233.

Kirkman, T.W. 1996. Statistics to Use, ANOVA: Analysis of Variance between groups. Date Query: 21-01-2015. Available in: http://www.physics.csbsju.edu/stats/Knapp, M., Clarke, A.C., Horsburgh, K.A., Matisoo-Smith,E.A. 2012. Setting the stage: Builiding and working in an ancient DNA Lab. Ann. Anat. 194: 3-6.

Kolman, C.J., Bermingham, E. 1997. mtDNA and nuclear DNA diversity in the Chocó and Chibcha Amerinds of Panamá. Genetics. 147: 1289.

Lalueza-Fox, C., Calderon, Fl., Calafell, F., Morera, B., Bertranpetit, J. 2001. mtDNA from extinct Tainos and the peopling of the Caribbean. Ann. Hum. Genet. 65: 137-151.

Lalueza-Fox, C., Gilbert, M.T.P., Martínez-Fuentes, A.J., Calafell, F., Bertranpetit, J. 2003. Mitochondrial DNA from pre-Columbian Ciboneys from Cuba and the prehistoric colonization of the Caribbean. Am. J. Phys. Anthropol. 121 (2): 97-108.

Lee, H.Y., Park, M.J., Kim, N.Y., Sim, J.E., Yang, W.I., Shin. K.J. 2010. Simple and highly effective DNA extraction methods from old skeletal remains using silica columns. Forensic Sci. Int. Genet. 4: 275-280.

Lewis, C.M., Tito, R.Y., Lizárraga, B., Stone, A.C. 2005. Land, language, and loci: mtDNA in Native Americans and the genetic history of Peru. Am. J. Phys. Anthropol. 127(3):351-60.

Lewis, C.M., Buikstra, J.E., Stone, A.C. 2007. Ancient DNA and genetic continuity in the South Central Andes. Lat. Am. Antiq. 18: 145-160.

Librado, P., Rozas, J. 2009. DnaSP v5: A software for comprehensive analysis of DNA polymorphism data. Bioinformatics. 25: 1451-1452.

Llamas, B., Fehren-Schmitz, L., Valverde, G., Soubrier, J., Mallick, S., Rohland, N., et al. 2016. Ancient mitocondrial DNA provides high-esolution time scale of the peopling of the Americas. Sci. Adv. 2:e1501385.

López-Castaño, C.E., Cano-Echeverry, M.C. 2011. En torno a los primeros poblamientos en el Noroccidente de Sudamérica: Acercamientos desde el valle Inter-Andino del Magdalena, Colombia. Boletín de Arqueología PUCP. (15): 43-79.

Malhi, R., Cybulski, J.S., Tito, R.Y., Johnson, J., Harry, H., Dan, C. 2010. Brief Communication: mitochondrial haplotype C4c confirmed as a founding genome in the Americas. Am. J. Phys. Anthropol. 141 (3): 494- 97.

Manríquez, G., Moraga, M., Santoro, C., Aspillaga, E., Arriaza, B.T., Rothhammer, F. 2011. Morphometric and mtDNA analyses of archaic skeletal remains from south western South America. Chungará (Arica). 43 (2): 283-292.

Marchant, R., Behling, H., Berrío, J.C., Cleef, A., Duivenvoorden, J., Hooghiemstra, H., et al. 2002. Pollen-based biome reconstructions for Colombia at 3000, 6000, 9000, 12000, 15000 and 1800014C yr ago: Late Quaternary tropical vegetation dynamics. J. Quat. Sci. 17: 113-129.

Martínez-Cruzado, J.C., Toro-Labrador, G., Viera-Viera, J., Rivera-Vega, M.Y., Startek, J., Latorre-Esteves, M., et al. 2005. Reconstructing the population history of Puerto Rico by means of mtDNA phylogeographic analysis. Am. J. Phys. Anthropol. 128: 131-155.

Martínez-Cruzado, J.C. 2010. The history of Amerindian mitochondrial DNA lineages in Puerto Rico. In: S.M. Fitzpatrick, A.H. Ross (editors). Island Shores, Distant Pasts: Archaeological and Biological approaches to the pre-Columbian settlement of the Caribbean. University Press of Florida, Gainsville-Florida, USA. p. 54-80.

Mata-Míguez, J., Overholtzer, L., Rodríguez-Alegría, E., Kemp, B.M., Bolnick, D.A. 2012. The Genetic Impact of Aztec Imperialism: Ancient Mitochondrial DNA Evidence from Xaltocan, Mexico. Am. J. Phys. Anthropol. 149 (4): 504-516.

Melton, P.E., Briceño, I., Gomez, A., Devor, E.J., Bernal, J.E., Crawford, M.H. 2007. Biological relationship between Central and South American Chibchan speaking populations: Evidence from mtDNA. Am. J. Phys. Anthropol. 132: 753-770.

Melton, P.E., Baldi, N.F., Barrantes, R., Crawford, M.H. 2013. Microevolution, migration, and the population structure of five Amerindian populations from Nicaragua and Costa Rica. Am. J. Hum. Biol. 25 (4): 480-490.

Mendisco, F., Keyser, C., Seldes, V., Rivolta, C., Mercolli, P., Cruz, P., et l. 2014. Genetic diversity of a late prehispanic group of the Quebrada de Humahuaca, northwestern Argentina. Ann. Hum. Genet. 78: 367-380.

Merriwether DA, Rothhammer F, Ferrel RE. 1995. Distribution of the four founding lineage haplotypes in Native Americans suggests a single wave of migration for the New World. Am. J. Phys. Anthropol. 98: 411-430.

Mesa, N.R., Mondragón, M.C., Soto, I.D., Parra, M.V., Duque, C., Ortíz-Barrientos, D., et al. 2000. Autosomal, mtDNA, and Y-chromosome diversity in Amerinds: Pre- and post-Columbian patterns of gene flow in South America. Am. J. Hum. Genet. 67: 1277-1286.

Meyer, S., Weiss, G., Von Haeseler, A. 1999. Pattern of nucleotide substitution and rate heterogeneity in the Hypervariable Regions I and II of human mtDNA. Genetics. 152 (3): 1103-1110.

Minelli, A., Cozzolino, M., Di Nucci, A., Guglielmi, S., Giannantonio, M., Dámore, D., et al. 2012. The Prehistory of the Colombian Territory: The results of the Italian archaeological investigation on the Checua Site (Municipality of Nemocón, Cundinamarca Department). J. Biol. Res. 85 (1): 95-97.

Monsalve, M.V., Cárdenas, F., Guhl, F., Delaney, A.D., Devine, D.V. 1996. Phylogenetic analysis of mtDNA lineages in South American mummies. Ann. Hum. Genet. 60: 293-303.

Moreno-Estrada, A., Gravel, S., Zakharia, F., Mchauley, J.L., Byrnes, J.K., Gignoux, C.R., et al. 2013. Reconstructing the Population Genetic History of the Caribbean. PLoS Genet. 9 (11): e1003925.

Mosch, C.J., Watson, P.J. 1997. An Ancient Rocky Mountain Caver. J. Caves Karst Stud. 59 (1): 10-14.

Mulligan, C.J., Kitchen, A., Miyamoto, M.M. 2008. Updated three-stage model for the Peopling of the Americas. PLoS One. 3 (9): e3199.

Nei, M., Kumar, S. 2000. Molecular Evolution and Phylogenetics. New York, USA: Oxford University Press.

Neves, W.A., Hubbe, M., Correal, G. 2007. Human skeletal remains from Sabana de Bogotá, Colombia: A case of Paleoamerican morphology late survival in South America? Am. J. Phys. Anthropol. 133 (4): 1080-1098.

O’Rourke, D.H., Hayes, M.G., Carlyle, S.W. 2000. Spatial and temporal stability of mtDNA haplogroup frequencies in native North America. Hum. Biol. 72: 15-34.

O’Rourke, D.H. 2009. Human Migrations: The Two Roads Taken. Curr. Biol. 19 (5): 203-205.

O’Rourke, D.H., Raff, J.A. 2010. The Human Genetic History of the Americas: The Final Frontier. Curr. Biol. 20: 202-207.

Pääbo, S., Poinar, H., Serre, D., Jaenicke-Despres, V., Hebler, J., Rohland, N., et al. (2004). Genetic analyses from ancient DNA. Annu. Rev. Genet. 38: 645-679.

Parson, W., Dür, A. 2007. EMPOP--a forensic mtDNA database. Forensic Sci Int Genet. 1 (2): 88-92.

Perego, U.A., Achilli, A., Angerhofer, N., Accetturo, M., Pala., M., Olivieri, A., et al. 2009. Distinctive Paleoamerican migration routes from Beringia marked by two rare mtDNA haplogroups. Curr. Biol. 19 (1): 1-8.

Perego, U.A., Lancioni, H., Tribaldos, M., Angerhofer, N., Ekins, J.E., Olivieri, A., et al. 2012. Decrypting the mitochondrial gene pool of modern Panamanians. PLoS One. 7 (6): e38337.

Pickrell, J., Reich, D. 2014. Towards a new history and geography of human genes informed by ancient DNA. Trends Genet. 30 (9): 377-389.

Pinto, M. 2003. Galindo, un Sitio a Cielo Abierto de Cazadores-

Recolectores en la Sabana de Bogotá. Bogotá: Fundación de Investigaciones Arqueológicas Nacionales, Banco de La República.

Pucciarelli, H., Perez, I., Politis, G. 2010. Early Holocene human remains from the Argentinean Pampas: Additional evidence for distinctive cranial morphology of Early South Americans. Am. J. Phys. Anthropol. 143: 298- 05.

Raff, J.A., Bolnick, D.A., Tackney, J., O’Rourke, D.H. 2011. Ancient DNA Perspectives on American colonization and population history. Am. J. Phys. Anthropol. 146: 503-514.

Rasmussen, M., Li, Y., Lindgreen, S., Pedersen, J.S., Albrechtsen, A., Moltke, I., et al. 2010. Ancient human genome sequence of an extinct Palaeo-Eskimo. Nature. 463: 757-762.

Rasmussen, M., Anzick, S.L., Waters, M.R., Skoglund, P., DeGiorgio, M., Stafford, T.W., et al. 2014. The genome of a Late Pleistocene human from a Clovis burial site in Western Montana. Nature. 506 (7487): 225- 29.

Rasmussen, M., Sikora, M., Albrechtsen, A., Korneliussen, T.S., Moreno-Mayar, V., Poznik, G.D., et al. 2015. The ancestry and affiliations of Kennewick Man. Nature. 523: 455-458.

Reich D, Patterson N, Campbell D, Tandon A, Mazieres S, Ray N, et al. 2012. Reconstructing Native American population history. Nature. 488 (7411): 370-374.

Reimer, P.J., Bard, E., Bayliss, A., Beck, J.W., Blackwell, P.G., Bronk-Ramsey, C., et al. 2013. IntCal13 and Marine13 Radiocarbon Age Calibration Curves 0-50,000 years Cal BP. Radiocarbon. 55 (4): 1869-1887.

Ribeiro-Dos-Santos, A.K.C., Santos, E.C.B., Machado, A.L., Guapindaia, M., Zago, M.A. 1996. Heterogeneity of mitochondrial DNA haplotypes in pre-Columbian natives of the Amazon region. Am. J. Phys. Anthropol. 101 (1): 29-37.

Rickards, O., Martínez-Labarga, C., Lum, J.K., De Stefano, G.F., Cann, R.L. 1999. mtDNA history of the Cayapa Amerinds of Ecuador: Detection of additional lineages for the Native American populations. Am. J. Hum. Genet. 65:519-530.

Rivera, S. 1991. Neusa 9000 Años de Presencia Humana en el Páramo. Bogotá: Fundación de Investigaciones Arqueológicas Nacionales, Banco de la República.

Rodríguez, J.V. 2011. Los Chibchas: Hijos del sol, la luna y los Andes. Del mito a la historia natural. Bogotá: Universidad Nacional de Colombia, IDU-UNC. 286p.

Rodas, C., Keyeux, G., Gelvez, N. 2003. Mitochondrial DNA studies show asymmetrical Amerindian admixture in Afro-Colombian and Mestizo populations. Hum. Biol. 75 (1): 13-30.

Rondón F, Braga Y, Barreto G. 2007. Análisis de la diversidad y el grado de estructura genética presente en poblaciones humanas colombianas a partir del uso de marcadores RFLPs de mtDNA. Rev. Asoc. Colomb. Cienc. Biol. 19: 94-103.

Ruhlen, M. 1991. A guide to the world’s languages, Vol. 1: Classification. CA: Stanford University Press. Salas, A., Acosta, A., Álvarez-Iglesias, V., Cerezo, M., Phillips, C., Lareu, M.V., et al. 2008. The mtDNA ancestry of admixed Colombian populations. Am. J. Hum. Biol. 20 (5): 584-591.

Saitou, N., Nei, M. 1987. The neighbor-joining method: A new method for reconstructing phylogenetic trees. Mol. Biol. Evol. 4: 406-425.

Sandoval, J.A., Almanza, O. 2012. Datación de esmalte dental prehispánico proveniente del sitio arqueológico Checua (Cundinamarca) por Resonancia Paramagnética Electrónica (EPR). Rev. Col. Fís. 44 (3): 248-252.

Silva, A., Briceño, I., Burgos, J., Torres, D., Villegas, V., Gómez, A., et al. 2008. Análisis de ADNmt en una muestra de restos óseos arcaicos del período Herrera de la Sabana de Bogotá. Biomédica. 28 (4): 569-77.

Soper, D.S. 2015. Analysis of Variance (ANOVA) Calculator - One-Way ANOVA from Summary Data. Date Query: 21- 01-2015. Available in: http://www.danielsoper.com/statcalc.

Stone, A.C., Stoneking, M. 1998. mtDNA Analysis of a Prehistoric Oneota population: Implications for the peopling of the New World. Am. J. Hum. Genet. 62: 1153-1170.

Stothert, K. 1985. The preceramic Las Vegas culture of coastal Ecuador. American Antiquity. 50: 613-637.

Tajima F. 1989. Statistical methods to test for nucleotide mutation hypothesis by DNA polymorphism. Genetics. 123: 585-595.

Tamm, E., Kivisild, T., Reidla, M., Metspalu, M., Smith, D.G., Mulligan, C.J., Bravi, C.M., et al. 2007. Beringian Standstill and spread of Native American founders. PLoS One. 9: e829.

Tamura, K., Stecher, G., Peterson, D., Filipski, A., Kumar, S. 2013. MEGA6: Molecular Evolutionary Genetics Analysis 6.0. Mol. Biol. Evol. 30: 2725-2729.

Tamura, K., Nei, M. 1993. Estimation of the number of nucleotide substitutions in the control region of mitochondrial DNA in humans and chimpanzees. Mol. Biol. Evol. 10: 512-526.

Usme-Romero, S., Alonso, M., Hernández-Cuervo, H., Yunis, J.E., Yunis, J.J. 2013. Genetic differences between Chibcha and Non-Chibcha speaking tribes based on mtDNA haplogroups from 21 Amerindian tribes from Colombia. Genet. Mol. Biol. 36 (2): 149-157.

Van der Hammen, T. 1986. Cambios medio-ambientales y la extinción del mastodonte en el norte de los Andes. Revista de Antropología. 2: 27-33.

Van der Hammen, T. 1997. El Bosque de Condalia. Caldasia. 19 (1-2): 355-359.

Van der Hammen, T., Correal, G. 2001. Mastodontes en un humedal Pleistocénico en el valle del Magdalena (Colombia) con evidencias de la presencia del hombre en el pleniglacial. Boletín de Arqueología. 16: 4-6.

Van der Hammen, T. 2006. Bases para una prehistoria ecológica amazónica y el caso de Chiribiquete. En: G. Morcote, S.Mora, C. Franky (editores). Pueblos y Paisajes antiguos de la selva amazónica. Universidad Nacional de Colombia, Facultad Ciencias, Taraxacum, Bogotá. p. 19-28.

Van der Hammen, T. 2011. Aspectos ambientales y paleoambientales de los enclaves secos y el caso particular del valle del Checua (Nemocón, Colombia). Pérez Arbelaezia. 19: 35-47.

Vilar, M.G., Melendez, C., Sanders, A.V., Walia, A., Gaieski, J.B., Owings, A.C., et al. 2014. Genetic diversity in Puerto Rico and its implications for the peopling of the Island and the West Indies. Am. J. Phys. Anthropol. 155 (3): 352-368.

Vona, G., Falchi, A., Moral, P., Calo, C., Varesi, L. 2005. Mitochondrial sequence variation in the Guahibo Amerindian population from Venezuela. Am. J. Phys. Anthropol. 127: 361-369.

Wang, S., Lewis, C.M., Jakobsson, M., Ramachandran, S., Ray, N., Bedoya, G., Rojas, W., et al. 2007. Genetic variation and population structure in Native Americans. PLoS Genet. 3 (11): e185.

Watkins, W.S., Xing, J., Huff, C., Whiterspoon D.J., Zhang, Y., Perego, U.A., et al. 2012. Genetic analysis of ancestry, admixture and selection in Bolivian and Totonac populations of the New World. BMC Genetics. 13: 39.

Willerslev, E., Cooper, A. 2005. Ancient DNA. Proc. Biol. Sci. 272: 3-16. Winters M, Barta JL, Monroe C, Kemp B. 2011. To Clone or Not To Clone: Method analysis for retrieving consensus sequences in ancient DNA Samples. PLoS One. 6(6):e21247.

Xavier, C., Builes, J.J., Gomes, V., Ospino, J.M., Aquino, J., Parson, W., et al. 2015. Admixture and Genetic Diversity Distribution Patterns of Non-Recombining Lineages of Native American Ancestry in Colombian opulations. PLoS One 10 (3): e0120155.

Yang, N.N., Mazières, S., Bravi, C., Ray, N., Wang, S., Burley, M.W., et al. 2010. Contrasting patterns of nuclear and mtDNA diversity in Native American populations. Ann. Hum. Genet. 74 (6): 525-538.

Yunis, J.J., Yunis, E.J. 2013. mtDNA haplogroups in 1526 unrelated individuals from 11 Departments of Colombia. Genet. Mol. Biol. 36 (3): 329-335.

Zegura, S.L., Karafet, T.M., Zhivotovsky, L.A., Hammer, M.F. 2004. High-Resolution SNPs and microsatellite haplotypes point to a single, recent entry of Native American Y chromosomes into the Americas. Mol. Biol. Evol. 21 (1): 164-175.




DOI: http://dx.doi.org/10.18257/raccefyn.328

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